Dyrekcja
- Dyrektor Wojewódzkiego Urzędu Pracy
- Zastępca Dyrektora WUP ds. Funduszy
- Zastępca Dyrektora WUP ds. Rynku Pracy
Główny Księgowy – Wydział Obsługi Budżetu i Funduszy, w tym:
- Oddział Finansów i Księgowości
- Zespół ds. Obsługi Finansowej Funduszy Europejskich
- Oddział ds. Obsługi Finansowej Funduszu Gwarantowanych Świadczeń Pracowniczych
Wydział Prawny
Zespół ds. Kadr
Wydział ds. Kontroli
Stanowisko ds. Kontroli Wewnętrznej
Wydział Organizacji i Administracji
Stanowisko ds. Bezpieczeństwa i Higieny Pracy
Wydział ds. Informatyki
Zespół ds. Promocji Doradztwa Zawodowego
Zespół ds. Zamówień Publicznych
Pełnomocnik ds. Ochrony Informacji Niejawnych
Inspektor Ochrony Danych
Rzecznik Prasowy
Wydział Polityki i Analiz Rynku Pracy, w tym:
- Oddział ds. Statystyki Publicznej
Wydział Realizacji Usług Rozwojowych
Wydział Wdrażania Funduszy Europejskich, w tym:
- Zespół Koordynacji i Monitorowania
- Oddział Projektów Konkurencyjnych
- Oddział Projektów Niekonkurencyjnych
Wydział ds. Funduszu Gwarantowanych Świadczeń Pracowniczych, w tym:
- Oddział ds. Wypłaty Świadczeń i Monitorowania Udzielonej Pomocy Publicznej
- Oddział ds. Dochodzenia Zwrotu Należności
Centrum Poradnictwa Zawodowego w Toruniu(CPZ) – jako Wydział, w tym:
- Centrum Poradnictwa Zawodowego – Oddział w Bydgoszczy
- Centrum Poradnictwa Zawodowego – Oddział we Włocławku
Wydział ds. Koordynacji Świadczeń i Obsługi Agencji Zatrudnienia, w tym:
- Zespół ds. Koordynacji Systemów Zabezpieczenia Społecznego
- Zespół ds. Obsługi Agencji Zatrudnienia